一、舊版N2000色譜工作站與一小部分新款型激光打印機(jī)不兼容（如推出的惠普和兄弟牌），目前全新版N2000色譜工作站（SP1版）已不存在這一現(xiàn)象，可以使用上述打印機(jī)。
二、 舊版N2000工作站在使用中，峰面積的zen后一位數(shù)通常是“0、3、7、2、5、8”，部分字例如“9”很少出現(xiàn)，反過(guò)來(lái)說(shuō)明工作站的積分算法是有缺陷的。此現(xiàn)象被有關(guān)部門稱之為“037現(xiàn)象”。新版N2000色譜工作站（SP1版）已完*此問(wèn)題。
三、舊版N2000工作站在使用中，經(jīng)常出現(xiàn)的色譜峰保留時(shí)間*一致的現(xiàn)象，被相關(guān)部門認(rèn)為是工作站分辨率不足。新版N2000色譜工作站（SP1版）已完*這個(gè)問(wèn)題。
 
四、 所有舊版工作站都是使用塑料外殼，所以對(duì)外界的干擾信號(hào)屏蔽不足，新版N2000色譜工作站（SP1版）采用鋁制外殼，抗干擾能力大大提升，基線的信噪比更強(qiáng)。
五、 現(xiàn)在新購(gòu)的舊版N2000色譜工作站已不提供保修與升級(jí)服務(wù)，而全新版N2000色譜工作站（SP1版）購(gòu)買并網(wǎng)上注冊(cè)后（可通過(guò)直接注冊(cè)、寄信等將注冊(cè)信息發(fā)到我司統(tǒng)一幫助注冊(cè)），可獲得我司對(duì)N2000色譜工作站（SP1版）的硬件三年質(zhì)保，軟件的*升級(jí)，即使不注冊(cè)也能得到一年的保修（人為因素除外）。
六、 新版N2000色譜工作站（SP1版）和舊版N2000工作站的操作習(xí)慣、界面都保持高度一致，以方便新老用戶操作。