首先，氫氣發生器主要由電解系統、壓力控制系統、凈化系統和顯示系統組成。電解采用目前膜分離技術，由紅外光電反饋裝置與開關電源組成的壓力控制系統，使氫氣的發生量根據輸出的需要自動調整，維持輸出流量和壓力的穩定。采用這種原理產生的氫氣存在的主要的問題有：  

    1. 加KOH水溶液的氫發生器所產生的氫氣中含水量高且帶有一定腐蝕性，容易造成色譜儀調試不穩定，一旦長時間使用該氫氣做載氣必然造成色譜柱柱效降低。  

    2．利用該原理產生的氫氣如果長時間使用，會造成嚴重的返液現象。為了防止返液，廠家設計了各種裝置來嘗試解決這個問題，但是均不能解決根本性的問題。畢竟它還是要加液的，一旦防返液的裝置出現故障就會造成氣路及色譜柱報廢，嚴重的甚至可能導致氣相色譜儀全部報廢。  

    3．氣體的純度大多沒有經過檢測，雖然可以通過基線和柱子使用壽命判斷其純度，結果卻是給色譜柱造成不必要的損失。    

    所以氫氣作為輔助氣還行，做載氣純度不夠。在選擇氫氣發生器時優先考慮質量有保證的廠家，也可以加裝在線純度檢測裝置保證氣體的純度。